Групповой этап в Кубке страны будет проводиться впервые в истории. Тридцать команд из трех дивизионов (Олимп-ПФЛ, Олимп-ФНЛ и Тинькофф РПЛ), поделенные на 10 групп (по три команды в каждой группе), сыграют в один круг. При этом каждая команда ПФЛ проведет дома обе игры, команда ФНЛ – всего одну и представители сильнейшей лиги сыграют оба матча на выезде. Групповой этап стартует 16-17 сентября и закончится 21-22 октября.
К победителям десяти групп присоединятся шесть участников еврокубков, которые были освобождены от квалификационных игр. Далее турнир продолжится в формате одноматчевого плей-офф уже в 2021 году.