Игровую карьеру Ямлиханов завершил в 2004 году в Воронеже, но уже в местном «Динамо», выступавшим в тот момент на КФК. Там же, в «Динамо», Радик Рамильевич начал и тренерскую деятельность в качестве ассистента. Следом Ямлиханов работал помощником главного тренера в «Иртыше» из Павлодара и украинском «Нефтянике-Укрнефть». В 2009 году специалист снова вернулся в Воронеж, на сей раз в «Факел» и в должности главного тренера.
В «Факеле» Ямлиханов проработал до 2013 года, в том числе и во второй команде. Следом Радик Рамильевич возглавил клуб «Выбор-Курбатово», так же из Воронежа. С 2018 года Ямлиханов входил в тренерский штаб Владимира Федотова в «Оренбурге».
